SSIN ima lastno strokovno službo, ki opravlja strokovna, administrativna in finančna dela za potrebe SSIN Ankaran.
Organizacijski tajnik je odgovoren za pravilno delovanje strokovne službe. Za njeno delo odgovarja predsedniku Sveta SSIN v skladu s splošnim aktom, Pravilnikom o notranji organizaciji in sistemizaciji delovnih mest strokovne službe SSIN.
V skladu s tem aktom so uslužbenci strokovne službe dolžni kar najbolj zavzeto sodelovati pri uresničevanju tega, kar predvideva prejšnji odstavek, ter se zavzemati za ustrezno in učinkovito delovanje same strokovne službe, kakor tudi vseh organov SSIN, kot določajo ta statut in drugi pravilniki, sporazumi, akti ali predpisi.
Medsebojne pravice, dolžnosti ter odgovornosti SSIN in strokovne službe se določijo s splošnim aktom SSIN, ki ga sprejme predsednik SSIN s soglasjem Sveta SSIN. V splošnem aktu se opredelijo tudi drugi akti, ki urejajo delovanje strokovne službe (organizacijska struktura itd.) in ki jih sprejme Svet SSIN.