Dejavnosti SSIN Ankaran se v skladu z zakonom financirajo iz proračuna Občine Ankaran v ustanavljanju, iz sredstev lokalne skupnosti, iz proračuna Republike Slovenije ter iz drugih virov.
SSIN Ankaran ima lahko tudi druge vire financiranja, ki izhajajo iz zakonodaje Republike Slovenije, iz mednarodnih sporazumov, iz sporazumov o sodelovanju z matičnim narodom, iz lastnih gospodarskih dejavnosti in iz drugih virov.