Javna agencija lahko posreduje prejemnikom razvojnih spodbud iz državnega proračuna:
Spodbude iz prejšnjega odstavka dodeljuje na podlagi sprejetega programa dela, mednarodnih pogodb in pogodb z neposrednimi proračunskimi uporabniki.
Finančne spodbude in druga sredstva iz prvega odstavka tega člena dodeljuje v skladu z zakoni in drugimi predpisi ter mednarodnimi pogodbami (finančnimi memorandumi, programskimi dokumenti pobud skupnosti idr.).
Pri dodeljevanju razvojnih spodbud se javna agencija povezuje z Javnim skladom Republike Slovenije za regionalni razvoj in ohranjanje poseljenosti slovenskega podeželja z namenom zagotavljanja usklajene in celovite ponudbe razvojnih spodbud uporabnikom.