O prihodu živali v karantenski objekt mora pooblaščeni veterinarski strokovni delavec pisno, v roku 24 ur, obvestiti veterinarskega inšpektorja in strokovne oziroma pooblaščene organizacije, ki so po odločbi veterinarskega inšpektorja zadolžene za jemanje vzorcev in opravljanje preiskav.
V karantenskem objektu je treba voditi evidenco o veterinarskosanitarnih posegih ter poginih, zakolih živali v sili in usmrtitvah.
Veterinarsko-sanitarni pregled uvoženih pošiljk pri razkladanju opravi pooblaščeni veterinarski strokovni delavec. Uvožene živali in izvajanje preventivnih ukrepov med karanteno nadzoruje veterinarski inšpektor.
Klinične preglede, zdravljenja, odvzem vzorcev in cepljenja uvoženih živali med karanteno opravlja pooblaščena veterinarska organizacija, ki jo z odločbo določi veterinarski inšpektor.
Odvzem vzorcev in cepljenja morajo biti opravljena v 10 dneh po razkladanju uvoženih živali.
Diagnostične laboratorijske preiskave uvoženih živali, živalskega semena, jajčnih celic, zarodkov in valilnih jajc opravi pooblaščeni diagnostični laboratorij. O izidu preiskav mora pisno obvestiti imetnika živali, veterinarskega inšpektorja in pooblaščene veterinarske organizacije pred pretekom roka predpisanega trajanja karantene. Poročilo o preiskavi mora vsebovati tudi strokovno mnenje.