Vsi pooblaščeni zavodi, ki uporabljajo radiofarmacevtske izdelke, so dolžni z radioaktivnimi odpadki, ki nastajajo pri delu (neporabljeni radiofarmacevtski izdelki, stična ovojnina, injekcijske igle, brizge, katetri in ostalo, kar se uporablja pri rokovanju), in radioaktivnimi izločki ravnati v skladu s pravilnikom o načinu zbiranja, evidentiranja, obdelave, hrambe, dokončne odložitve in izpuščanja radioaktivnih odpadnih snovi v človekovo okolje (Uradni list SRS, št. 40/86).
Ko pade radioaktivnost radioaktivnih odpadkov ali izločkov pod mejo, ki jo določa pravilnik iz prejšnjega odstavka, se lahko zavržejo z ostalimi sanitetnimi odpadki. Pri tem je uporabnik dolžan odstraniti (prekriti) mednarodno oznako za radioaktivnost.