Članice univerze usmerjajo znanstveno-raziskovalno delo s programom. Program znanstveno-raziskovalnega dela, s katerim se uresničuje nacionalni program visokega šolstva, sprejme senat članice univerze po predhodnem soglasju senata univerze.
Pri oblikovanju programa znanstveno-raziskovalnega dela upoštevajo članice univerze področja nacionalnega pomena in težišča raziskovalne dejavnosti, ki jih sprejme senat univerze.