Višina sofinanciranja se določi po podpisu sporazuma, dogovora ali memoranduma o sodelovanju Republike Slovenije v projektu oziroma programu. Sofinanciranje je namenjeno izvajalcu projekta oziroma programa v Republiki Sloveniji neposredno.
Iz sredstev ministrstva se lahko sofinancira:
Ministrstvo upravičencem do subvencij po predpisih o financiranju raziskovalno-razvojnih projektov oziroma tehnološkega razvoja (Pravilnik o vzpodbujanju tehnološkega razvoja, Uradni list RS, št. 37/94) dodatno financira letno do 25% vrednosti slovenskega deleža v projektu oziroma do največ 12,000.000 SIT za industrijsko-razvojne projekte (EUREKA) in do 2,500.000 SIT za druge projekte. Višina dodatnega financiranja za industrijsko-razvojne projekte (EUREKA) bo v sorazmerju s skupno vrednostjo projekta oziroma dejanske udeležbe slovenskih izvajalcev pri projektu.
Pri projektih, ki so vključeni v programe mednarodnega znanstvenega in tehnološkega sodelovanja in je v tem okviru opravljeno mednarodno kakovostno ocenjevanje, se postopek ocenjevanja, ki ga določa pravilnik o pogojih in metodologiji izbora in financiranja projektov temeljnega in aplikativnega raziskovanja ter razvoja (Uradni list RS, št. 5/94) v delu, ki se nanaša na recenzijo, ne opravi.