Organ upravljanja centra je svet centra.
Sestavljajo ga:
Predstavnike delavcev v svetu volijo delavci neposredno, predstavnike ustanoviteljev imenuje Vlada Republike Slovenije na predlog Ministrstva za šolstvo in šport, Ministrstva za delo, družino in socialne zadeve in Ministrstva za znanost in tehnologijo. Ostale predstavnike imenujejo pristojni organi teh organizacij oziroma zvez v skladu z njihovimi akti.
Predsednika sveta centra imenuje svet izmed svojih članov.
Svet centra sklepa veljavno, če je na seji navzoča večina vseh njegovih članov.
Mandat sveta centra traja 4 leta. Po preteku mandata so lahko člani sveta ponovno izvoljeni.