Zavezanec iz tretjega odstavka 17. člena zakona mora plačati obračunano razliko trošarine v skladu s petim odstavkom 7. člena odredbe o računih ter načinu vplačevanja in razporejanja javnofinančnih prihodkov (Uradni list RS, št. 81/94, 48/99, 74/99, 110/99 in 37/00), in sicer:
V obeh primerih iz prejšnjega odstavka zavezanec poleg številke vplačilnega računa na nalogu za prenos navede tudi modul 05 in številko sklica odobritve: davčna številka plačnika – 052001.
Obračun razlike trošarine se sestavi ločeno za tobačne izdelke in za alkohol in alkoholne pijače v skladu z vzorcema obračuna, ki sta prilogi k temu pravilniku in sta njen sestavni del.