Nacionalni sklad lahko izda agenciji pogojno akreditacijo za določen čas, če agencija izpolnjuje pogoje obveznosti zagotavljanja pisnih postopkov, nezdružljivost nalog odobritve obveznosti in izplačil sredstev iz programa SAPARD, nalog izvrševanja izplačil ter nalog računovodstva obveznosti in izplačil. Agencija mora izpolnjevati tudi pogoja varnosti računalniškega sistema in notranje revizije v agenciji.
Če do preteka veljavnosti pogojne akreditacije agencija ne izpolni vseh pogojev za akreditacijo, ki so določeni s to uredbo, jo nacionalni sklad agenciji odvzame.