Predstojnika Slovenske čebelarske akademije imenuje direktor inštituta po pridobitvi mnenja programskega odbora in s predhodnim soglasjem ministra, pristojnega za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano.
Naloge predstojnika Slovenske čebelarske akademije so:
Predstojnik Slovenske čebelarske akademije je vodja organizacijske enote inštituta, v kateri se izvaja dejavnost Slovenske čebelarske akademije.
Način ter pogoji imenovanja in razrešitve, pravice, dolžnosti in odgovornosti predstojnika Slovenske čebelarske akademije se podrobneje opredelijo v statutu inštituta.