Javna agencija je oseba javnega prava s pravicami, obveznostmi in odgovornostmi, določenimi z Zakonom o spodbujanju skladnega regionalnega razvoja (Uradni list RS, št. 56/03) in to uredbo.
Javna agencija se vpiše v sodni register pri Okrožnem sodišču v Ljubljani.
Ustanovitelj javne agencije je Republika Slovenija.
Pravice in obveznosti ustanovitelja izvršuje Vlada Republike Slovenije.
Posamezne odločitve v okviru ustanoviteljskih pravic in obveznosti vladi predlaga državni organ, pristojen za področje regionalnega razvoja.