Delo sekretariata v republiškem izvršnem svetu vodi sekretar, delo druge samostojne strokovne službe pa šef službe; imenuje in razrešuje ju republiški izvršni svet. Sekretar oziroma šef službe je za delo sekretariata oziroma samostojne strokovne službe odgovoren republiškemu izvršnemu svetu.
Sekretar sekretariata oziroma šef službe ima glede delavcev v delovni skupnosti samostojne strokovne službe pravice in dolžnosti funkcionarja, ki vodi republiški upravni organ.
Sekretar sekretariata oziroma šef druge samostojne strokovne službe v republiškem izvršnem svetu ima lahko namestnika.