Generalnega direktorja imenuje minister, pristojen za kulturo (v nadaljnjem besedilu: minister) na podlagi javnega razpisa ter po predhodnem mnenju sveta in strokovnega sveta. Poleg javnega razpisa lahko minister povabi posamezne kandidate tudi neposredno.
Če svet oziroma strokovni svet ne poda mnenja iz prejšnjega odstavka v roku 30 dni od dneva, ko je bil zanj zaprošen, se šteje, da je mnenje pozitivno.
Na podlagi akta o imenovanju sklene pogodbo o zaposlitvi z generalnim direktorjem predsednik sveta zavoda po predhodnem soglasju ministra. Delovno razmerje z generalnim direktorjem se sklene za določen čas, za čas trajanja mandata.