Sklad ima nadzorni odbor, ki šteje 9 članov in jih imenuje Državni zbor Republike Slovenije.
Nadzorni odbor nadzira zakonitost dela in finančno poslovanje Sklada. Nadzorni odbor najmanj enkrat letno poroča o delovanju Sklada Državnemu zboru Republike Slovenije.
Nadzorni odbor lahko angažira pri svojem delu tudi strokovne institucije in neodvisne strokovnjake.