Urad spremlja izvajanje dejavnosti in izpolnjevanje obveznosti nosilca nacionalnega etalona, ki so navedene v V. poglavju tega pravilnika in v določilih pogodbe, na podlagi predložene dokumentacije in kontrolnih pregledov.
Če se ugotovi, da prihaja pri delu nosilca nacionalnega etalona do nepravilnosti oziroma odstopanj, lahko urad izda odločbo o začasnem odvzemu priznanja etalona za nacionalni etalon. Pri tem navede ugotovljena odstopanja in določi rok, v katerem morajo biti odstopanja odpravljena. Prav tako urad začasno prekine sofinanciranje po pogodbi.
Začasni odvzem priznanja etalona za nacionalni etalon oziroma začasna prekinitev sofinanciranja lahko traja največ 12 mesecev. Če nosilec nacionalnega etalona do izteka postavljenega roka ne odpravi ugotovljenih odstopanj, urad razveljavi odločbo o priznanju etalona za nacionalni etalon in razdre pogodbo o sofinanciranju. V tem primeru zahteva od pravne osebe, kateri je bila razveljavljena odločba o priznanju etalona za nacionalni etalon, vrnitev sredstev, izplačanih v zadnjih 12 mesecih, skupaj z zamudnimi obrestmi.
V primeru hujših kršitev nosilca nacionalnega etalona pri izvajanju dejavnosti in izpolnjevanju obveznosti lahko urad razveljavi odločbo o priznanju etalona za nacionalni etalon brez predhodnega začasnega odvzema priznanja etalona za nacionalni etalon. Tudi v tem primeru zahteva od pravne osebe, kateri je bila razveljavljena odločba o priznanju etalona za nacionalni etalon, vrnitev sredstev, izplačanih v zadnjih 12 mesecih, skupaj z zamudnimi obrestmi.