Ministrstvo je dolžno preveriti skladnost prejetih obračunov subvencije in zahtevkov za nadomestilo stroškov izvajanja subvencionirane študentske prehrane.
Ministrstvo nakaže obračunano subvencijo pooblaščeni študentski organizaciji v roku 60 dni od prejema obračuna.
V enakem roku poravna ministrstvo pooblaščeni študentski organizaciji tudi zahtevek za nadomestilo stroškov pri izvajanju subvencionirane študentske prehrane.