CEEPN financirajo predvsem organizacije iz sistema Združenih narodov in mednarodne multilateralne in bilateralne razvojne agencije. Drugi vir financiranja so prostovoljni prispevki ali donacije in druga sredstva, vključno s sredstvi, ki jih zagotavljajo posebni sporazumi ter prihodki, ki jih ustvarja CEEPN s svojimi storitvami.
CEEPN se ne financira s prispevki članic, razen če upravni odbor ne odloči drugače.
Omejenemu številu mednarodnih agencij, ki bodo finančno podpirale delovanje CEEPN, bo dodeljen status uradnih sponzorjev CEEPN-in jim bo zagotovljen status opazovalca na sejah upravnega odbora brez pravice glasovanja.