Prometne sekcije, sekcije za vleko, sekcije za vzdrževanje prog ter sekcije za vzdrževanje signalnovarnostnih naprav in sredstev za zvezo železniškega transportnega podjetja poslujejo kot obrati z notranjim obračunom, druge sekcije, ki se ukvarjajo z izdelovanjem in vzdrževanjem transportnih sredstev ali z drugimi dejavnostmi v okviru podjetja, pa lahko poslujejo kot obrati z notranjim obračunom ali kot obrati s samostojnim obračunom.
Sekcija železniškega transportnega podjetja, ki posluje kot obrat s samostojnim obračunom, lahko postane po splošnih predpisih samostojno podjetje.
Natančnejše določbe o notranji organizaciji železniškega transportnega podjetja in njegovih sekcij ter o njihovem poslovanju so v pravilih podjetja.