Predlog izbora projektov in njihovih izvajalcev ter poročilo o rezultatih ocenjevanja (v nadaljevanju: predlog) izdelajo programski sveti za ciljne raziskovalne programe posameznega ministrstva.
Programski sveti izdelajo predlog v roku 30 dni od prejema prijav. Prijave jim posreduje MZT, skupaj z oceno ustreznosti odgovornih nosilcev projektov – oziroma članov projektnih skupin – kriterijem kakovosti.