Vsak zdravstveni center ima poseben strokovni svet.
Strokovni svet obravnava važnejša strokovna vprašanja ter daje mnenja o poročilih in predlogih, ki jih daje zdravstveni center pristojnim organom in zainteresiranim delovnim in drugim organizacijam.
Strokovni svet sestavljajo: določeno število članov izmed strokovnjakov zdravstvenega zavoda, ki opravlja naloge zdravstvenega centra: strokovnjaki določenih zdravstvenih zavodov z območja zdravstvenega centra: določeno število članov, ki jih delegirajo strokovna društva zdravstvenih delavcev ter dva člana, ki jih imenuje svet za zdravstvo ustrezne družbeno-politične skupnosti izmed strokovnjakov za vprašanja iz delovnega področja zdravstvenega centra.
Člani strokovnega sveta republiškega zdravstvenega centra so tudi upravniki tistih okrajnih zdravstvenih centrov, ki jih določi Svet za zdravstvo LRS, člani strokovnega sveta okrajnega zdravstvenega centra pa upravniki tistih občinskih zdravstvenik centrov, ki jih določi svet za zdravstva okrajnega ljudskega odbora.
V strokovni svet republiškega zdravstvenega centra delegirajo po enega člana tudi določeni visokošolski zavodi.
Direktor zdravstvenega zavoda, ki opravlja naloge zdravstvenega centra, je po položaju član strokovnega sveta.
Število članov strokovnega sveta ter zavodi, društva in visokošolski zavodi, ki imenujejo oziroma delegirajo člane v strokovni svet se določijo s statutom zavoda, ki opravlja naloge zdravstvenega centra.