Direktor, ki opravlja funkcijo poslovnega in programskega direktorja, zastopa, predstavlja in vodi poslovanje zavoda ter odgovarja za zakonitost in strokovnost dela zavoda.
Direktor mora pri vodenju poslov ravnati z javnimi sredstvi s skrbnostjo dobrega gospodarstvenika.
Direktorja imenuje ustanovitelj, na podlagi javnega razpisa ter po predhodnem mnenju sveta zavoda. Hkrati z objavo javnega razpisa lahko ustanovitelj povabi k prijavi na razpis posamezne kandidate tudi neposredno.
Za vodenje postopka do imenovanja direktorja zavoda župan s sklepom imenuje petčlansko komisijo. Dva člana predlaga svet zavoda. Župan je predlog sveta zavoda za imenovanje komisije dolžan upoštevati. Komisija pripravi javni razpis, pregleda vloge in ustanovitelju v imenovanje predlaga najprimernejšega kandidata. Mandat direktorja traja pet let, po izteku te dobe je lahko ponovno imenovan.
Na podlagi akta o imenovanju direktorja, podpiše z njim pogodbo o zaposlitvi v imenu sveta zavoda njegov predsednik. Delovno razmerje z direktorjem se sklene za čas trajanja mandata.