Sredstva za izvajanje svoje dejavnosti zavod pridobiva:
1.
iz Sklada za financiranje razgradnje Nuklearne elektrarne Krško in odlaganja radioaktivnih odpadkov iz Nuklearne elektrarne Krško (v nadaljnjem besedilu: namenski sklad) za financiranje storitev obdelave radioaktivnih odpadkov in izrabljenega goriva pred odlaganjem ter odlaganje radioaktivnih odpadkov in izrabljenega goriva iz jedrskih objektov za proizvodnjo energije, kamor se uvrščajo naslednje dejavnosti:
-
umeščanje in gradnja odlagališča nizko in srednje radioaktivnih odpadkov,
-
izdelava programa razgradnje,
-
iskanje rešitve za odlaganje izrabljenega goriva in visoko radioaktivnih odpadkov,
2.
s plačili uporabnikov skladišča in odlagališča radioaktivnih odpadkov v skladu s ceno storitev zavoda za financiranje: prevzemanja, zbiranja, prevažanja, predhodne obdelave in skladiščenje pred odlaganjem ter odlaganje radioaktivnih odpadkov in izrabljenega goriva, ki niso odpadki oziroma izrabljeno gorivo iz jedrskih objektov za proizvodnjo energije,
3.
iz proračuna ustanovitelja za financiranje:
-
storitev prevzemanja, zbiranja, prevažanja, predhodne obdelave in skladiščenja pred odlaganjem ter odlaganje radioaktivnih odpadkov in izrabljenega goriva, ki niso odpadki oziroma izrabljeno gorivo iz jedrskih objektov za proizvodnjo energije, v vrednostih, ki presegajo plačila malih povzročiteljev radioaktivnih odpadkov znanega izvora,
-
storitev prevzemanja, zbiranja, prevažanja, predhodne obdelave in skladiščenje pred odlaganjem ter odlaganje radioaktivnih odpadkov in izrabljenega goriva, ki niso odpadki oziroma izrabljeno gorivo iz jedrskih objektov za proizvodnjo energije neznanih povzročiteljev radioaktivnih odpadkov,
-
obratovanja in dekontaminacije centralnega skladišča radioaktivnih odpadkov,
-
dolgoročnega nadzora in vzdrževanja odlagališč rudarske in hidrometalurške jalovine, ki nastane pri pridobivanju in izkoriščanju jedrskih mineralnih surovin,
-
dejavnosti, ki so povezane z umeščanjem in gradnjo odlagališča nizko in srednje radioaktivnih odpadkov v deležu, ki se obračunava kot investicijski vložek države za delovanje zavoda in je določen v nacionalnem ali operativnem programu ravnanja z radioaktivnimi odpadki in izrabljenim gorivom,
4.
iz drugih virov.
Zavod z namenskim skladom za vsako leto sklene pogodbo o ureditvi medsebojnih razmerij in sofinanciranju programa dela.
Zavod z ustanoviteljem vsako leto sklene pogodbo o financiranju dejavnosti iz proračuna.