Za izvajanje tega protokola se ustanovi skupni odbor za znanstveno in tehnološko sodelovanje.
Naloge skupnega odbora so:
Skupni odbor se običajno sestaja vsaki dve leti izmenično v Sloveniji in Egiptu ter sklene programe za uresničevanje, ki vsebujejo sklepe in predloge skupnih zasedanj. Sestane se vsakokrat, ko je potrebno.