Generalni direktor ima namestnika. V primeru zadržanosti oziroma odsotnosti generalnega direktorja, predstavlja in zastopa agencijo namestnik generalnega direktorja ter opravlja druge naloge, ki so v pristojnosti generalnega direktorja.
Generalnega direktorja in njegovega namestnika imenuje Državni zbor.
Generalni direktor lahko prenese opravljanje določenih nalog na namestnika generalnega direktorja.
Generalni direktor ima pomočnike, ki načrtujejo, organizirajo, vodijo in nadzorujejo izvajanje nalog iz tega statuta.