Organ upravljanja zavoda je svet zavoda.
Svet zavoda šteje devet članov, od katerih:
-
tri člane izvolijo izmed sebe delavci na način, po postopku in pod pogoji, določenimi z zakonom in statutom zavoda,
-
preostale člane imenuje Vlada Republike Slovenije, in sicer po enega na predlog ministrstva, pristojnega za kulturo, ministrstva, pristojnega za znanost, ministrstva, pristojnega za finance, senata Univerze v Ljubljani, Gospodarske zbornice Slovenije in Slovenske akademije znanosti in umetnosti.
Mandat članov sveta zavoda traja pet let in so po poteku te dobe lahko ponovno imenovani oziroma izvoljeni.
Predsednika sveta zavoda imenuje svet zavoda izmed predstavnikov ustanovitelja.
Svet zavoda sklepa veljavno, če je na seji sveta navzoča večina vseh članov sveta.
Svet zavoda sprejema odločitve z večino glasov navzočih članov, razen statuta in letnega programa dela, ki se sprejemajo z večino glasov vseh članov sveta zavoda.