Vladi držav pogodbenic ustanovita mešano komisijo za izvajanje tega sporazuma, v katero vsaka stran imenuje po tri predstavnike.
Mešana komisija se sestane na zahteve ene ali druge strani, izmenoma v Republiki Sloveniji in Republiki Hrvaški.
Mešana komisija je pristojna za razlago tega sporazuma in za razreševanje sporov, ki bi nastali pri njegovem izvajanju.