Zahtevek za vračilo preveč plačanih prihodkov ali napačno vplačanih prihodkov vloži pravna oseba – zavezanec za vplačilo davkov, prispevkov, taks in drugih prihodkov pri tistem organu, ki določa obveznosti plačila prihodkov, ki so predmet zahtevka, in ki nadzoruje njihovo vplačevanje, hkrati s plačilnim nalogom. Na podlagi utemeljenega zahtevka ali druge podlage pristojni organ potrdi plačilni nalog zavezanca in ga izroči enoti agencije, da ga izvrši.
V primeru vračila davka na dodano vrednost po obračunu zavezanec ne predloži plačilnega naloga k zahtevku za vračilo tega davka.
Na plačilnem nalogu za vračilo preveč plačanih davkov, carin, prispevkov in drugih prihodkov, mora pristojna organizacijska enota agencije vpisati podatke v predpolje in v polje sklicevanja na številko obremenitve z modelom 04.
Preveč ali napačno vplačani prihodki se vrnejo v breme vplačilnih računov, v dobro katerih so bili vplačani. Če na vplačilnih računih ni sredstev, mora sredstva za preveč ali napačno vplačane obveznosti takoj zagotoviti prejemnik sredstev z vplačilom na ustrezne vplačilne račune. Preveč ali napačno vplačani prihodki na prehodne račune, se vrnejo v breme prehodnih računov, v dobro katerih so bili vplačani, pri tem pa se sredstva na prehodnih računih zagotovijo iz vplačilnih računov na katere so bili preveč ali napačno vplačani prihodki razporejeni.