Kot posvetovalno telo urada deluje Komisija za reševanje spornih primerov razvrščanja enot poslovnega registra po SKIS (v nadaljnjem besedilu: komisija).
Komisijo sestavljajo po dva predstavnika: Agencije Republike Slovenije za javnopravne evidence in storitve, Ministrstva za finance Republike Slovenije, Banke Slovenije in urada. Člane komisije imenuje generalni direktor urada na predlog institucij, ki jih predstavljajo.
Za namen dela komisije se poleg podatkov poslovnega registra in drugih registrov in evidenc državnih organov uporabljajo vsi podatki, pridobljeni iz raziskav, ki se izvajajo na podlagi programa statističnih raziskovanj. Poleg teh podatkov so enote poslovnega registra dolžne, na zahtevo urada, pošiljati še dodatne podatke, ki kažejo za sektorizacijo relevantne karakteristike, opredeljene v Prilogi.
Komisija s poslovnikom natančneje določi svojo organizacijo, naloge in način dela.