Višina sredstev je določena v proračunu za tekoče leto. Sredstva se dodelijo upravičencem po vrstnem redu prispelih popolnih vlog. Sredstva se dodeljujejo do višine porabe proračunskih sredstev tekočega leta za ta namen. Upravičenec je upravičen do subvencije samo enkrat.
Višina subvencije za vsako MKČN je 800,00 eur za posamezno stanovanjsko oziroma večstanovanjsko stavbo. V primeru čiščenja odpadnih vod iz večstanovanjskih z eno MKČN je do sredstev upravičena vsaka posamezna stavba, vendar ne več kot nabavne vrednosti MKČN brez DDV.