Sekretar stalne arbitraže organizira, pripravlja ter vodi delo, ki je potrebno za delovanje stalne arbitraže.
Sekretar opravlja strokovne in druge naloge po naročilu predsednika, pripravlja gradivo za seje predsedstva, pripravi letno poročilo in finančni plan in opravlja naloge določene s tem pravilnikom.
Sekretar spremlja potek posameznih postopkov pred stalno arbitražo, se udeležuje obravnav in v okviru svojih nalog strokovno sodeluje z arbitri.