SCE ima upravni organ, ki šteje najmanj tri člane (upravni organ).
Upravni organ vodi SCE, določa temelje njene dejavnosti in nadzoruje njeno opravljanje.
Upravni organ mora sklicati občni zbor vedno, kadar to zahtevajo koristi SCE.
Določbe predpisov, ki določajo pravice in obveznosti upravnega odbora oziroma nadzornega odbora zadruge, se uporabljajo tudi za upravni organ SCE, če določbe tega poglavja ne urejajo pravic in obveznosti upravnega organa in izvršnih direktorjev drugače.