Za štipendiste ministrstva Republika Slovenija zagotavlja do 250 mest za bivanje v študentskih domovih, ki jih je ustanovila Republika Slovenija oziroma se financirajo ali sofinancirajo iz javnih sredstev.
Razdelitev mest za bivanje štipendistov opravi ministrstvo v sodelovanju z izvajalci štipendiranja. Način plačila in druga medsebojna razmerja uredijo ministrstvo, izvajalec štipendiranja in študentski domovi z vsakoletno večstransko pogodbo.
Štipendistom ministrstva se zaračunava subvencionirana stanarina. Ministrstvo oziroma izvajalec štipendiranja stanarino poravnava neposredno študentskemu domu iz odobrene štipendije.
Javni študentski domovi lahko namenijo do 10 odstotkov svojih zmogljivosti tudi drugim tujim študentom, ki prihajajo na visokošolske zavode v okviru izmenjalnih programov (predvsem programa Vseživljenjsko učenje). O razdelitvi teh zmogljivosti se visokošolski zavodi vsako leto dogovorijo neposredno s študentskimi domovi. Uporabniki teh zmogljivosti plačujejo neekonomsko stanarino, povišano za subvencijo.