Celotni odsek trase avtoceste je treba pred gradnjo fotodokumentirati v skladu z navodili službe za varstvo naravne dediščine.
Ker se pri zemeljskih delih lahko odkrijejo objekti geološke naravne dediščine oziroma naravne vrednote (paleontološke, strukturne, mineraloške), je potreben občasen naravovarstveno-geološki nadzor na celotnem območju gradnje. Nadzor mora izvajati strokovna geološka institucija. V primeru pomembnejših geoloških najdb je treba obvestiti strokovno organizacijo (Agencijo Republike Slovenije za okolje ali Zavod za varstvo narave, Območno enoto Kranj), ki poda strokovne smernice glede ohranjanja dediščine oziroma nadaljnjega ukrepanja.
Med gradnjo se je treba izogibati vsem začasnim posegom v stoječe vode, vodotoke ali v njihove puferske pasove, ki jih označuje grmovna ali drevesna vegetacija. Preprečiti je treba odlaganje vsakršnega gradbenega ali izkopanega materiala, splakovanje delovnega orodja v okoliških vodah, spuščanje betonskega mleka ali cementnih odpadkov v okoliške vode ter odtekanje naftnih derivatov, ki se uporabljajo za delovanje gradbenih strojev in prevoznih sredstev. Vse naravno ohranjene vodotoke je treba med gradnjo varovati.
Pred pričetkom gradnje je treba obvestiti o predvidenem začetku in poteku del ter sproti o vsakem posegu v vodotoke Ribiško družino Radovljica ter ji omogočiti ogled gradbišč ob vodah. V primeru uničenja vodnega življa krije stroške Ribiški družini Radovljica investitor.
Ohranijo se obstoječi habitati piškurjev, sladkovodnih vrst rib in rakov oziroma se v primeru škode sonaravno uredijo.
V času izvajanja del je potrebno sprejeti ukrepe za zaščito naravne reprodukcije (prepoved direktnega poseganja v strugo v času drsti).
Živalim se nekontrolirano prehajanje čez avtocesto prepreči z varnostno žično ograjo višine 2 m. Vsem živalskim vrstam, ki jim bo z izgradnjo avtoceste prekinjena migracijska pot, se zagotovi varno prehajanje preko avtoceste iz severa proti jugu preko projektirane trase v okviru že obstoječih naravnih poti, ki so čim bliže migracijski poti velikih živali na tem območju. Po končani gradnji novega in rekonstrukciji obstoječega viadukta preko Lešnice bo potrebno izdelati ustrezno migracijsko pot za velike živali vzdolž leve strani struge (vzhodni breg), ki bo:
Investitor mora zagotoviti monitoring prehodov živali pred, med in po gradnji in v prvih treh oziroma štirih letih delovanja ceste.