Bolnišnice izvajajo specialistično ambulantno dejavnost in specialistično bolnišnično dejavnost.
Specialistična ambulantna dejavnost je nadaljevanje oziroma dopolnitev osnovne zdravstvene dejavnosti ter obsega poglobljeno diagnostiko, zdravljenje bolezni ali bolezenskih stanj ter izvajanje ambulantne rehabilitacije.
Specialistična bolnišnična dejavnost obsega poglobljeno diagnostiko, zdravljenje in medicinsko rehabilitacijo, zdravstveno nego, nastanitev in prehrano.
Bolnišnica mora imeti poleg enot, ki jih določa drugi odstavek 15. člena zakona o zdravstveni dejavnosti, organizirano tudi najmanj enoto za opravljanje ene neoperativne in ene operativne stroke, vključno z diagnostičnimi dejavnostmi, ki omogočajo izvajanje teh dejavnosti.
Določbe prejšnjega odstavka se ne uporabljajo za specialistične bolnišnice na področju psihiatrije.