Zavod pridobiva sredstva za opravljanje javne službe iz državnega proračuna in iz proračuna Občine Škocjan v skladu z zakoni in Statutom Občine Škocjan, iz prispevkov staršev, za nadstandardne storitve z darili, lahko pa tudi iz drugih virov v skladu z zakonom.
Z odlokom o proračunu Občine Škocjan in pogodbo se določi letna višina sredstev za pokrivanje dejavnosti zavoda na podlagi dogovorjenih in finančno ovrednotenih nalog iz letnega delovnega načrta zavoda in v skladu s sprejetimi merili, ki določajo obseg financiranja VIZ.