ekretariat SNAV, ki ga imenuje vlada, operativno usklajuje aktivnosti za delovanje SNAV, skrbi za usklajeno izvedbo stališč SNAV ter opravlja druge naloge za SNAV. Strokovna in administrativno tehnična dela za sekretariat SNAV opravlja služba, ki jo določi vlada.
Sekretariat SNAV sestavljajo:
-
direktor SOVE, ki vodi sekretariat,
-
generalni direktor Policije,
-
načelnik Generalštaba Slovenske vojske,
-
državni sekretar v Ministrstvu za zunanje zadeve,
-
državni sekretar v Ministrstvu za obrambo,
-
direktor Obveščevalno varnostne službe pri Ministrstvu za obrambo,
-
poveljnik Štaba Republike Slovenije za civilno zaščito,
-
direktorica Službe Vlade Republike Slovenije za zakonodajo,
-
svetovalec predsednika vlade za nacionalno varnost oziroma oseba, ki jo ta določi.