Generalni sekretar ima namestnika, ki ga imenuje komisija za volitve, imenovanja in administrativne zadeve Državnega zbora na predlog generalnega sekretarja.
Namestnik generalnega sekretarja vodi in koordinira delo na področju priprave in poteka sej Državnega zbora in njegovih delovnih teles ter mednarodnega sodelovanja Državnega zbora.
Namestnik nadomešča generalnega sekretarja v njegovi odsotnosti.