Pri uporabi škropilnega vlaka je treba upoštevati navodila za uporabo, ki jih je izdal proizvajalec škropilnega vlaka.
Med škropljenjem mora eden od delavcev spremljati vremenske razmere, zato mora biti obvezno vključen termometer ali anemometer.
Delovna hitrost škropilnega vlaka v naseljenih območjih ne sme presegati 20 km/h. Izjema so odseki na odprtih progah, kjer zaradi obremenjenosti proge to ne bi bilo mogoče. Na teh odsekih je dovoljena hitrost največ 30 km/h, pod pogojem, da je škropilna armatura opremljena z zaščitnimi zavesami za preprečevanje odnašanja škropiva.
Delovna širina škropljenja škropilnega vlaka na odprtih progah je največ 5,7 m, pri čemer morajo biti ločeni desni, levi in sredinski krak škropilne naprave.