Ministrstvo za pravosodje in upravo opravlja zadeve, ki se nanašajo na organizacijo in zagotavljanje pogojev za delovanje sodišč, javnih tožilstev in drugih pravosodnih organov; na poslovanje in druga vprašanja pravosodne uprave sodišč ter organov za postopek o prekrških; na izvrševanje kazenskih sankcij in na kazenske poboljševalne zavode; na pravno pomoč in na mednarodno pravno pomoč; na pomilostitve; na sistem organizacije in delovanja upravnih organov; na sistem sredstev za delo državnih organov; na izpopolnjevanje strokovne izobrazbe delavcev v upravnih in pravosodnih organih; na lokalno samoupravo in na območja občin; na nadzorstvo nad izvajanjem predpisov o upravnem postopku in na druge zadeve obče uprave; na ugovor vesti vojaški obveznosti; na razlastitev in druge prisilne posege v pravice glede nepremičnin v upravnem postopku, razen kmetijskih prostorskih ureditvenih operacij.
Republiška uprava za kadre opravlja strokovne naloge, ki se nanašajo na skupne naloge republiških upravnih organov (razen organov za notranje zadeve in obrambo) pri načrtovanju kadrov, zaposlovanju in drugih vprašanjih s področja delovnih razmerij, pri urejanju osebnih dohodkov, izobraževanju, štipendiranju in varstvu pri delu; na strokovne in organizacijske naloge s kadrovskega področja za Izvršni svet in njegova delovna telesa; na strokovne naloge s področja odlikovanj.
Republiška uprava skupnih služb opravlja strokovne naloge, ki se nanašajo ria skupne naloge republiških upravnih organov (razen organov za notranje zadeve in obrambo) ter pravosodnih organov pri investicijah, investicijskem in tekočem vzdrževanju zgradb; pridobivanju in odtujevanju nepremičnin Republike Slovenije; upravljanju in gospodarjenju s stanovanji, stanovanjskimi hišami in počitniškimi domovi; pri opravljanju finančno računovodskih, administrativno tehničnih in pomožnih nalogah.
Republiški zavod za informatiko opravlja strokovne naloge, ki se nanašajo na delovanje računskega centra republiških upravnih organov in skupne telekomunikacijske mreže državnih organov; na zagotavljanje skupnih telekomunikacijskih storitev in elektronske pošte; na aplikativne projekte, na programsko opremo za skupne potrebe ali za potrebe posameznih državnih organov; na metodološko in tehnološko koordinacijo pri povezovanju in uporabi skupnih baz podatkov državnih organov.
Kazenski poboljševalni zavodi opravljajo zadeve, ki se nanašajo na neposredno izvrševanje kazenskih sankcij.