Za uresničevanje ciljev, določenih s ciljnim raziskovalnim programom, je pristojen in odgovoren vodja programa in programski odbor.
Pristojnosti vodje programa so:
Pristojnosti programskega odbora ciljnega raziskovalnega programa so:
Predsednik programskega odbora ima položaj nacionalnega koordinatorja in sodeluje pri delu nacionalnega sveta za raziskave in razvoj oziroma področnih svetov, kadar obravnavajo vprašanja, ki s tičejo ciljnega raziskovalnega programa.