V državnem proračunu se določi višina sredstev za:
-
raziskovalne programe,
-
infrastrukturno dejavnost in
-
ustanoviteljske obveznosti.
ZRS Koper pridobiva sredstva iz prejšnjega odstavka na podlagi programa dela ZRS Koper h kateremu je dala soglasje Vlada RS. Program je pripravljen za obdobje petih let in vsebuje:
-
znanstveno-raziskovalno usmeritev,
-
program raziskovalne dejavnosti z opredelitvijo obsega javne službe ter raziskovalnega dela za trg;
-
opredelitev infrastrukturne dejavnosti,
-
fiksne stroške upravljanja javnega raziskovalnega zavoda,
-
fiksne stroške za financiranje in instrumentalnih centrov in zbirk ter
-
sistemizacijo programskih in infrastrukturnih skupin.
Program dela ZRS, Koper pripravi direktor na predlog vodij programskih skupin, v skladu s predpisi ministrstva, pristojnega za znanost. Upravni odbor ZRS, Koper po predhodnem mnenju znanstvenega sveta sprejme program dela ZRS Koper.