Nacionalni koordinatorji ocenijo prijave na javni razpis ter oblikujejo predloge za subvencioniranje raziskovalne opreme najkasneje v 30 dneh od dneva prejema dokumentacije.
Ocene in predloge izdelajo nacionalni koordinatorji na vprašalniku, ki ga predpiše minister. Pri ocenjevanju predlogov za subvencioniranje ter oblikovanju svojih predlogov je nacionalni koordinator samostojen.
Če nacionalni koordinator meni, da bi pridobitev dodatnih strokovnih mnenj bistveno prispevala h kakovosti ocene ali oblikovanju predlogov, predlaga to ministru v odobritev.