Za izvajanje tega sporazuma pogodbenici ustanovita Skupni odbor za znanstveno in tehnološko sodelovanje (v nadaljevanju: Skupni odbor), sestavljen iz enakega števila predstavnikov in izvedencev pogodbenic.
Skupni odbor načrtuje in usklajuje sodelovanje v znanosti in tehnologiji ter presoja razvoj sodelovanja.
Če je treba, predlaga dejavnosti za uresničitev rezultatov, doseženih pri sodelovanju.
Skupni odbor dela v skladu s statutom, ki je sprejet s podpisom obeh ministrov.
Srečanja Skupnega odbora so vsako leto ali na zahtevo ene od pogodbenic izmenično v Republiki Sloveniji in v Češki republiki.