Inštitut ima sedemčlanski upravni odbor, ki ga sestavljajo: trije predstavniki ustanovitelja, dva predstavnika članov inštituta, en predstavnik delavcev in predsednik inštituta.
Predstavnike ustanovitelja imenuje Vlada Republike Slovenije. Mandat predstavnikov ustanovitelja je štiri leta od dneva imenovanja in so po izteku tega obdobja lahko vnovič imenovani. Predstavnike članov inštituta imenuje skupščina izmed članov inštituta. Delavci inštituta izvolijo svojega predstavnika z neposrednimi in tajnimi volitvami.
Vsak član upravnega odbora ima en glas.
Upravni odbor opravlja naslednje naloge: