V 15. členu se četrti odstavek spremeni tako, da se glasi:
"(4) Agencija mora o zahtevi za dodelitev vlakovne poti, ki jo je prejela od prosilca ali ji jo je poslal pristojni organ države, na ozemlju katere je izhodiščna točka določene prevozne storitve v železniškem prometu, odločiti najkasneje v 60 dneh od prejema popolne vloge. V postopku dodeljevanja vlakovne poti se uporabljajo določbe zakona, ki ureja splošni upravni postopek, če s tem zakonom ni drugače določeno. Zoper odločbo agencije lahko prosilec vloži pritožbo na regulatorni organ. Vloga, ki je bila zavrnjena zaradi nezadostnih infrastrukturnih zmogljivosti, se ponovno prouči ob naslednji prilagoditvi voznega reda omrežja, če tako zahteva prosilec. Zainteresiranim strankam morajo biti na voljo datumi teh prilagoditev. Agencija praviloma dodeljuje vlakovne poti enkrat letno ob pripravi novega voznega reda omrežja za naslednje vozno-redno obdobje.".
V petem, šestem in enajstem odstavku beseda "upravljavec" nadomesti z besedo "agencija" v ustreznem sklonu.
V šestem odstavku se v tretji alinei za besedo "uporabnino" postavi podpičje in črta besedilo "ki jo bo prejel".
Besedilo osmega odstavka se spremeni tako, da se glasi:
"(8) Vlada določi način uporabe kriterijev in pomen posameznega kriterija iz šestega odstavka tega člena.".
Za osmim odstavkom se dodata nova deveti in deseti odstavek, ki se glasita:
"(9) Prevozniki Evropske skupnosti imajo prost dostop do javnega železniškega omrežja v Republiki Sloveniji, z namenom opravljanja vseh vrst storitev prevoza blaga.
(10) Dostop po tirih do terminalov, vključno z opravljanjem storitev v njih, in dostop do pristanišč, povezanih z železniškimi dejavnostmi iz tega člena, ki jih uporablja ali bi jih lahko uporabljal en ali več končnih odjemalcev, se nediskriminatorno in pregledno zagotovi vsem prevoznikom v železniškem prometu. Zahteve prevoznika po dostopu pa se lahko omejijo samo, če za to obstajajo druge rešitve na železnici, ki so izvedljive pod tržnimi pogoji.".
Dosedanji deveti odstavek, ki postane enajsti odstavek, se spremeni tako, da se glasi:
"(11) Za uporabo javne železniške infrastrukture prevoznik upravljavcu plačuje uporabnino. Uporabnina je namenjena kritju stroškov vzdrževanja javne železniške infrastrukture.".
V dosedanjem desetem odstavku, ki postane dvanajsti odstavek, se v prvi alinei besedilo "in modernizacije" nadomesti z besedilom "in dograditev".
Dosedanji enajsti in dvanajsti odstavek postaneta nov trinajsti in štirinajsti odstavek.