Ministrstvo za zdravje opravlja zadeve, ki se nanašajo na zdravstveno varstvo in zdravstveno zavarovanje; na zdravstvene dejavnosti na primarni, sekundarni in terciarni ravni; na spremljanje zdravstvenega stanja prebivalstva in pripravo ter izvajanje programov za krepitev zdravja; na ekonomske odnose v zdravstvu in naloge, vezane na ustanoviteljstvo javnih zdravstvenih zavodov v skladu z zakonom; na zdravstvene ukrepe ob naravnih in drugih nesrečah; na varstvo prebivalstva pred boleznimi odvisnosti; na varstvo prebivalstva pred nalezljivimi boleznimi in HIV okužbami; na zdravstveno ustreznost živil v smislu kakovosti hranilne sestave in higienske ustreznosti živil in pitne vode zaradi preprečevanja kemičnega, biološkega in radiološkega onesnaženja ter vodenje politike prehranjevanja prebivalcev; na proizvodnjo, promet in preskrbo z zdravili in medicinskimi potrebščinami; na proizvodnjo in promet s strupi in mamili; na zdravstveno ustreznost predmetov splošne uporabe; na zdravstveno-ekološke probleme okolja, kjer je vpliv na človeka neposreden, ki se nanašajo na pitno vodo, kopalne vode, zrak, tla, hrup in vibracije; na ravnanje z odpadki z vidika varovanja zdravja prebivalcev; na varstvo človeka pred ionizirnimi in neionizirnimi sevanji v bivalnem in delovnem okolju; na pogoje za jemanje in presajevanje delov človeškega telesa ter na oblikovanje in izvajanje mednarodnih sporazumov o socialni varnosti.
Urad Republike Slovenije za sodelovanje s Svetovno zdravstveno organizacijo opravlja naloge, ki se nanašajo na sodelovanje s Svetovno zdravstveno organizacijo in z državami, članicami te organizacije, z drugimi mednarodnimi organizacijami Združenih narodov, z ustreznimi mednarodnimi inštitucijami ter na promocijo slovenskega zdravstva.
Urad Republike Slovenije za zdravila izvaja naloge na področjih proizvodnje in prometa z zdravili in medicinskimi pripomočki.
Urad Republike Slovenije za kemikalije izvaja naloge na upravnih področjih nevarnih snovi, kemičnega orožja, kozmetike in nadzora pesticidov in drugih kemijskih onesnaževalcev v živilih in pitni vodi.
Zdravstveni inšpektorat Republike Slovenije nadzoruje izvrševanje zakonov, drugih predpisov in splošnih aktov, ki urejajo zdravstveno sanitarno, zdravstveno higiensko in zdravstveno ekološko varstvo prebivalstva; izvršuje zdravstveni nadzor nad bivalnim in delovnim okoljem in drugod, kjer je vpliv na človeka neposreden, in sicer nad imisijskimi vrednostmi kvalitete tal in zraka, nad hrupom, vibracijami in vodami, vključno z obalnim morjem in kopalnimi vodami; nad živili, vključno s pitno vodo, nad predmeti splošne uporabe, nad zdravili, mamili, strupi, viri ionizirnih in neionizirnih sevanj, nad zdravstvenim varstvom delavcev v zvezi z delom, nad odpadki v zdravstvenih zavodih in nad snovmi, ki vplivajo na zdravje, vključno s snovmi s kasnimi učinki na zdravje (genotoksičnost in kancerogenost); izvršuje zdravstveno nadzorstvo na državni meji.