V območje mejnega prehoda sodi območje in neposredna okolica z objekti, ki so potrebni za smotrno in varno odvijanje prometa in učinkovito opravljanje mejne kontrole.
V območje mejnega prehoda na letališčih spadajo zlasti prostor za opravljanje mejne kontrole, tranzitni prostori za potnike v mednarodnem prometu, letališki plato, prostori za prtljago ter drugi prostori in objekti, ki so potrebni za opravljanje mejne kontrole.
V območje mejnega prehoda za cestni promet spada zlasti kraj, kjer se opravlja mejna kontrola, cestne in druge komunikacije, bankine, parkirni prostori, skladišča in drugi pomožni objekti, ki se nahajajo na območju med mejno črto in krajem, kjer se opravlja mejna kontrola, ter drugi objekti, ki so potrebni za opravljanje mejne kontrole.
V območje mejnega prehoda v pristanišču spada zlasti fizično omejen del pristanišča, objekti potrebni za opravljanje mejne kontrole ali določen del obale, ki je potrebna za opravljanje mejne kontrole in del morja okoli ladje, kjer je ta vezana ali zasidrana.
V območje mejnega prehoda za železniški promet spada poleg tira še peron in funkcionalno omejen oziroma ločen del železniškega postajališča, ki je namenjen potnikom in prtljagi ter tovoru v železniškem prometu.