Strokovni vodja Kobilarne Lipica je odgovoren za strokovnost dela organizacijske enote Kobilarna.
Strokovni vodja predlaga direktorju program porabe javnih sredstev in sredstev iz dohodka organizacijske enote Kobilarna.
Strokovni vodja je za svoje delo odgovoren direktorju zavoda.
Naloge in pristojnosti pomočnika strokovnega vodje Kobilarne Lipica ter način njegovega imenovanja se podrobneje določijo v statutu Kobilarne Lipica.