Komisija opravlja naslednje naloge:
Strokovne, administrativne in tehnične naloge za komisijo opravlja ministrstvo, pristojno za finance, predvsem pa:
Pri opravljanju svojih nalog komisija in ministrstvo, pristojno za fianace, sodelujeta z organi, ki v Republiki Sloveniji skrbijo za nadzor finančnega poslovanja državnih organov.